Služba zdravstvene zaštite je timski organizirana služba koja obavlja poslove u koordinaciji s liječnicima, socijalnom službom i odjelnim osobljem u dnevnoj i noćnoj smjeni. Pored provođenja primarne zdravstvene zaštite, koja zauzima važno mjesto u djelatnosti zavoda, ova služba obavlja i njegu korisnika te kontinuirano radi s korisnicima na njihovom osvješćivanju o potrebi održavanja osobne higijene. U suradnji sa socijalnom službom provodi programe rehabilitacije korisnika tj. upućivanje korisnika na vikende i dopuste, opskrba lijekovima za to razdoblje, stalna edukacija u rehabilitaciji korisnika na temu uzimanja lijekova u kućnim uvjetima i kontakti s obiteljima pri pružanju informacija o zdravstvenom stanju korisnika.